Wykaz aparatów i urządzeń, z którymi współpracuje BBMS:
LabMind: Skaner 2D SBS, Skaner Veri, Suwnice Agata i Adjunct, Roboty Yeti i Wall-B, Hotel 
PerkinElmer (Bioanalytic): JANUS Automated Workstation, PlateStak
Applied Biosystems (Polgen): ABI-Sequencer 3130 Genetic Analyzer
Roche: PCR/RealTime - LightCycler® 480 System
Bio-Rad: CFX96 and CFX384 Real-Time PCR Detection Systems
BioMicroLab (Polgen): XL9, XL20, XL100, XL200 Tube Handler
3DHISTECH (Sysmex): Pannoramic 250 FLASH II: zintegrowany formularz BBMS
New Brunswick (Eppendorf): C760 i inne - monitoring RS485
Micronic (Polgen): Scanner 2D - Tracxer Code Reader - wszystkie wersje
Fluidx (Bioanalytic): Scanner 2D - wszystkie wersje
KBiosystems (Bioanalytic): Sealer
Polgen: Decapper
Biometra (Bioanalytic): ThermoCycler TRobot
Sigma (Polygen): wirówka 4-16K
QUANTIFOIL Instruments (Bioanalytic): BioShake 3000
ATS sp. j.: LANkontroler - czujniki warunków środowiskowych, czujniki cyfrowe i analogowe
PolLab: Q-MSystem
RadWag (LabMind): moduł MAS220
Ponadto:
- skanery ręczne 1D/2D - dowolna firma
- drukarki kodów kreskowych: Zebra (ZPL), Sato (E+) i Brady (LFC)
- drukarki graficzne - dowolna firma

Powyższe nazwy oraz marki mogą należeć do ich odnośnych właścicieli i zostały użyte wyłącznie w celu identyfikacji.